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형광리포터 제브라피쉬 협력센터 활용안내

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작성자 관리자 작성일22-01-18 09:46 조회695회 댓글0건

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[형광리포터 제브라피쉬 협력센터 활용안내 공지 전달]

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제브라피쉬 연구자 분들께,
안녕하십니까.

작년 11월 제브라피쉬 심포지엄에서 소개드렸던 “형광리포터 제브라피쉬 협력센터 (Fluorescent Reporter Zebrafish Cooperation Center, FRZCC)”를 맡아 운영하게 된 고려대학교 박해철입니다. 제브라피쉬 연구자분들게 고려대학교 안산병원 내의 의생명연구센터에 설립된 FRZCC가 만들어진 목적과 역할, 그리고 연구자분들께서 FRZCC를 어떻게 활용하실 수 있는지에 대하여 안내를 드리고자 메일을 드립니다. 추가적인 내용은 첨부드린 PDF 파일을 참고하시기를 부탁드립니다. 특히 본 메일에서 FRZCC의 활용방법 안내를 읽어보시고 진행하시는 연구에 도움이 되도록 잘 활용하시기를 부탁드리고 FRZCC 운영 및 서비스에 궁금하신 점이나 조언이 있으시면 저와 실무담당자인 김환기 박사에게 언제든지 연락주시면 답변을 드리겠습니다. 형광리포터 제브라피쉬 협력센터에 많은  관심과 활용을 부탁드립니다.

감사합니다.

박해철 배상

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1. 형광리포터 제브라피쉬 협력센터(FRZCC) 설립목적

▶ FRZCC는 국가생명연구자원 선진화 사업에서 대표적 모델동물인 마우스, 초파리, 제브라피쉬의 수요자 중심 활용연구를 지원하고자 설립된 “모델동물 클러스터” 사업의 일환으로 설립되었습니다. 첨부된 파일에서 보시듯이 형광리포터 제브라피쉬는 특정 조직 및 세포 특이적으로 형광단백질을 발현함으로서 필요한 세포를 in vivo에서 형광이미징으로 관찰할 수 있는 transgenic 제브라피쉬를 의미하며, 발생, 질환, 신약개발 및 독성연구 등 제브라피쉬를 활용한 모든 연구분야에서 가장 많이 활용되고 있는 연구소재입니다.

▶ 우수한 형광리포터 제브라피쉬의 제조에는 E.coli-based homologous recombination이나 knock-in등의 고도의 유전자 조작 기술과 오랜 시간과 노력이 필요하여 연구자들이 쉽게 개발하지 못하는 어려움이 있습니다. 따라서 해외에서는 오래전부터 미국의 Zebrafish International Resource Center (ZIRC)와 같은 소재은행에서 개별연구자들에 의하여 개발된 형광리포터 라인들을 기탁받아 필요한 연구자들에게 분양해 줌으로서 연구자들이 필요한 형광리포터 라인을 손쉽게 연구에 활용할 수 있도록 역할을 하고 있습니다.

▶ 하지만 국내에서는 검역의 문제점으로 인하여 해외의 stock center에서 연구용 제브라피쉬 라인의 수입이 어려운 상황이며, 또한 국내 연구진에 의하여 개별적으로 확보된 소재의 분양시스템이 활성화 되지 않아서 제브라피쉬 연구자들이 필요한 형광리포터 제브라피쉬의 확보에 어려움이 많았습니다. FRZCC는 이러한 문제점을 해결하고 보다 손쉽고 효율적으로 제브라피쉬 연구자들에게 형광리포터 제브라피쉬 라인을 보급하는 역할을 수행하고자 설립이 되었습니다.



2. FRZCC의 역할

: FRZCC는 국외 및 국내의 형광리포터 제브라피쉬 라인을 필요로 하는 연구자분들게 공급해드리고자 아래와 같은 역할을 수행하고 있습니다(첨부파일 참조).

● 해외 Stock Center에서의 형광리포터 라인의 수입 및 공급
● 국내 연구자들에 의하여 개발된 형광리포터 라인의 데이터 베이스 구축을 통한 소재공유 시스템 구축 및 공유 활성화
● 협력센터에서 수요자 중심의 자체적인 형광리포터 라인 개발 및 공급(Knock-in 기반)
● In vivo 이미징 기반의 형광리포터 분석 및 활용기술 개발 및 보급

▶ 협력센터는 현재 해외소재 수입을 원활하게 하기 위하여 협력센터 내에 수입 물고기의 검역을 위한 지정검역소 설치를 완료하였으며, 미국의 ZIRC와 협의하여ZIRC로부터 국내 연구진들이 필요로 하는 형광리포터 라인들을 협력센터가 수입하여 공급하기 위한 협의를 완료하였습니다. 또한 작년 11월의 제브라피쉬 심포지엄에서 발표드린대로 자체적으로 knock-in 기반의 형광리포터 제브라피쉬 제조기술을 확립하였으며, 다양한 이미징 장비를 이용한 cryosection, 조직투명화 기술(tissue clarity), time-lapse live imaging, high contens screeing 기술등의 다양한 이미징 기술을 확립하였습니다. 특히 보다 효율적인 협력센터 기능을 수행하기 위하여 협력센터 전담 박사급 연구교수 와 전담 연구원을 고용하고 해외소재 수입 및 분양과 knock-in 제조등의 업무를 전담하는 시스템을 구축하고 있습니다.

▶ 기존의 제브라피쉬 자원거점은행인 충남대학교의 질환모델링 제브라피쉬소재은행(김철희 교수님)은 knock-out 기반의 희귀질환 제브라피쉬모델 구축에 중점을 두고 있으며 FRZCC는 형광리포터 소재 확보 및 분양이 목표로서 차별성이 있습니다.

FRZCC 실무 담당자: 김환기 박사(zelkovae@korea.ac.kr, 031-412-6725)



3. 연구자들에 의한 FRZCC의 활용방법 안내

  ● 미국 ZIRC로부터의 형광리포터 라인 수입

▶ 수입과정: ZIRC로부터 국내로의 라인 도입을 FRZCC가 수행하기로 협의가 되었으며 연구자분들께서 ZIRC로부터 필요한 형광리포터 라인이 있으신 경우에는 저희 협력센터로 연락주시면 수입과정을 대행해 드리고자 합니다. 형광리포터 라인의 수입에는 LMO 신고, ZIRC와의 MTA (Material Transfer Agreement) 작성, 라인의 배송, 그리고 최종적으로 수입된 라인의 국내에서의 검역을 위한 고려대학교 안암병원 동물실 담당 수의사와 국립수산물품질관리원(수품원) 담당자의 참관 등, 복잡한 과정이 필요합니다. 따라서 수시로 라인 도입을 하기에는 어려움이 있기에 연구자분들의 요청을 모아서 월 1회정도 수입절차를 진행하고자 합니다. ZIRC로부터 라인의 도입을 원하시는 연구자분들 께서는 저희 협력센터 담장자인 김환기 박사에게 연락을 주시면 자세한 사항을 안내해 드리겠습니다.

▶ 수입비용: 형광리포터 라인의 수입을 위해서는 ZIRC로부터 국내로의 배송비용, 인천공항에서 협력센터 지정검역소로의 배송비용, 그리고 수입대행료 등의 비용이 발생합니다. 현재 계획은 개별 연구자별로 연 1회정도는 협력센터 예산에서 수입비용을 지원해 드리고 추가로 요청하시는 경우에는 수입 실비비용을 연구자분께서 부담하시도록 계획하고 있습니다.  FRZCC 실무 담당자: 김환기 박사(zelkovae@korea.ac.kr, 031-412-6725)

  ● Knock-in 제브라피쉬 제조 요청

▶ Knock-in 기반의 형광리포터 라인은 타겟유전자의 coding region에 형광단백질 발현 유전자를 삽입함으로서 heterozygote 상태에서는 형광리포터로 활용가능하며 homozygote 상태에서는 knock-out 라인으로 활용이 가능하여 활용성이 많은 라인입니다. 저희 협력센터는 Knock-in 기반의 형광리포터 제조기술을 확립하였으며, 연구자분들게 최대한 많은 라인을 적극적으로 보급해드리기 위하여 최근에 협력센터 전담 박사급 연구교수 와 전담 연구원을 고용하고 knock-in 제조를 위한 전 과정을 training하고 있습니다.

▶ Knock-in 라인의 제조는 1년 이상의 시간과 많은 노력이 필요하기에 실질적인 공급을 위해서는 비용 및 대상 유전자의 선별 등 협의가 필요한 부분들이 있기에 협력센터가 구축하는 시스템이 확립이 되는 대로 서비스에 대한 방침을 확정하여 안내드리도록 하겠습니다. Konck-in 라인의 제조에 관심이 있으신 연구자분들께서는 협력센터 실무담당자인 김환기 박사님께 연락주시기를 부탁드립니다.

  ● 국내의 형광리포터 제브라피쉬 데이터베이스 구축 및 공유

▶ FRZCC에는 협력센터가 시작되기 이전에 이미 100여종 이상의 형광리포터 라인을 확보하여 보유하고 있으며, 국내의 제브라피쉬 연구자분들에 의하여 개별적으로 확보된 형광리포터 제브라피쉬 라인도 다수가 있는 것으로 파악이 되고 있습니다. 따라서 해외에서 라인을 도입하거나 신규로 제작하는 것도 중요하지만 무엇보다도 국내에 이미 확보되어 있는 형광리포터 라인들의 현황을 파악하고 데이터베이스를 구축하여 필요로 하는 연구자들이 손쉽게 공유할 수 있는 시스템을 구축하는 것이 필요합니다. FRZCC에서는 현재 자체보유하고 있는 라인들과 국내의 개별 연구자들이 확보하고 있는 라인들에 대한 데이터베이스 구축작업을 진행중에 있으며 조만간 자체 홈페이지를 통하여 공유할 수 있는 시스템을 구축할 예정입니다.

▶ 형광리포터 라인의 공유에 있어서 고려되어야 할 점은 해외에서 개별적으로 도입한 라인들 중에서 라인을 제공한 연구자/기관과 Material Transfer Agreement (MTA)를 작성한 경우에는 원저자의 허락을 받고 라인을 공유해야 한다는 것입니다. 서류작업이나 원저자에게 동의를 구하는 과정이 번거롭기는 하지만 그래도 해외에서 다시 도입하는 것보다는 시간적/경재적으로 유리하기에 국내 보유자원의 공유 시스템을 구축하는 일이 가장 중요할 것으로 생각이 됩니다. 협력센터 자체 홈페이지 작업과 국내 자원의 데이터베이스 구축작업이 완료 되는대로 공유시스템에 대하여 연구자분들게 다시한번 공지 메일을 드리도록 하겠습니다.

  ● FRZCC로부터 분양받은 라인의 사사표기 방법

▶ FRZCC로부터 분양받으신 라인으로 논문을 출간하실때에는 논문의 Materials and Methods에 아래 예시와 같이 분양받으신 형광리포터 라인 이름 다음에 FRZCC로부터 분양받았음을 나타내는 출처(FRZCC 고유번호 기재)를 기재해 주시면 됩니다.  Materials and Methods에 출처표기방법 예시: Tg(olig2:dsred) (FRZCC 1121)

▶ FRZCC의 연구성과 평가에서는 제브라피쉬 연구자분들께서 분양받은 형광리포터 라인을 활용한 논문에 FRZCC가 사사되는 것이 중요합니다. 이미 분양을 받으신 연구자분들께서는 논문출간전에 문의를 주시면 저희가 보내드린 라인들에 대한 FRZCC 고유번호를 알려드릴테니 꼭 출처표기를 해주시기를 부탁드립니다.

▶ 논문출간시에 형광리포터 라인의 출처표기를 독려드리기 위하여 논문에 FRZCC 출처표기를 해주신 연구자분들께는 기본 1회 이외에 추가로 무료로 해외 ZIRC에서의 라인도입 서비스를 해 드릴 예정이며 knock-in 기반의 형광리포터 라인제작시에 우선적으로 고려를 하도록 하겠습니다.

  ● 이미징 기반의 형광리포터 제브라피쉬 분석기술 보급을 통한 활용성 증대

▶ 첨부드린 파일을 보시면 FRZCC는 ▲cryosection을 통한 조직절편 제조 및 형광분석, ▲조직투명화(tissue clarity)기술을 이용한 조직의 in vivo imaging, ▲Time-lapse live 이미징을 통한 동영상 제조 및 분석, ▲High Contents Screening 장비를 이용한 고속 형광 이미징 기술(신약탐색 및 독성분석)등을 확립하고 관련장비들을 확보하고 있습니다. 향후 협력센터 워크샵 등을 통하여 관련기술을 보급해 드릴 예정이며, 필요로 하시는 연구자분들께는 허용되는 범위에서 분석 서비스도 제공해 드릴 예정이니 관심있으신 연구자분들 께서는 저나 실무담당자인 김환기 박사에게 연락주시면 상담해드리겠습니다.

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